Как указано в протоколе о порядке взимания косвенных налогов, документы, подтверждающие ставку НДС 0%, нужно подать в течение 180 календарных дней с даты отгрузки товара. От соблюдения этого условия зависит, чем руководствоваться, устанавливая момент определения базы по НДС, - протоколом или НК РФ.
Письмо Минфина России от 02.09.2016 N 03-07-13/1/51480