Если налоговый агент в соответствии со статьей 231 НК РФ производит в 2016 году возврат налогоплательщику излишне удержанной суммы НДФЛ из его дохода, полученного в 2015 году, то такая сумма должна быть отражена по строке 090 раздела 1 расчета по форме 6-НДФЛ за соответствующий период 2016 года. В разделе 2 расчета данная операция не отражается. При этом налоговый агент должен представить в ИФНС уточненные сведения о доходах физических лиц по форме 2-НДФЛ за 2015 год.
Письмо ФНС России от 14.11.2016 N БС-4-11/21536@