Согласование субподрядчиков необходимо, если прописано в договоре (ст. 706 ГК). С налогами этот вопрос напрямую не связан. Их нельзя доначислять только из-за несогласованного субподрядчика (см. постановления АС Волго-Вятского от 23.05.2019 № А79-897/2018, Уральского от 26.04.2018 № А47-7013/2017 округов).