Спецрежим для сельхозпроизводителей больше не освобождает от НДС. После перехода на ЕСХН компания может работать без НДС, только если сразу заявит освобождение.
Если вы уже работаете на спецрежиме, то сможете получить освобождение, если доходы за 2018 год не превысили 100 млн руб.
Пункты 1, 3–5 статьи 145 НК (в ред. Федерального закона от 27.11.2018 № 335-ФЗ)