Банки обязаны следить за долей НДС в обороте по счету. Но они не обратят внимания на неверную ставку в платежке. Для них важна сумма налога, которую компания перечисляет в бюджет (Методические рекомендации, утв. ЦБ 16.02.2018 № 5-МР).
При проверках деклараций по НДС инспекция может запросить у банка выписки по счетам компании (п. 2 ст. 86, ст. 93.1 НК). В них кредитная организация отражает по каждой операции ее назначение, которое берет из платежки.Для ФНС неверная ставка в платежных документах не важна, если продавец правильно исчислил налог. Его компания рассчитывает и предъявляет покупателю в счете-фактуре. Поэтому важна информация именно в этом документе. Аналогичное мнение высказал Минфин в отношении спецрежимов (письмо от 18.11.2014 № 03-07-14/58618).