Инспекции не принимают формализованные пояснения. Программа ФНС не может сопоставить ответ компании и автотребование и не принимает пояснения в обработку.
Тем более что формат требования с 25 апреля обновили (письмо ФНС от 12.02.2019 № ЕД-4-15/2364).

В ответ на обращения главбухов налоговики рекомендуют отправить пояснения не ответным, а обычным письмом по электронке или почте.
Компания обязана отправить инспекторам квитанцию о получении в течение шести рабочих дней, после того как они отправили требование (п. 2 ст. 6.1 , п. 5.1 ст. 23 НК). Затем у компании есть пять рабочих дней, чтобы ответить на запрос (п. 3 ст. 88 НК).