Переплату по налогам, пеням и штрафам можно зачесть независимо от того, к какому виду относятся налоги – федеральным, региональным или местным. Зачет между налогами и страховыми взносами по-прежнему невозможен.
Налоговый агент вправе зачесть переплату по НДС и налогу на прибыль в счет налогов, которые платит как налогоплательщик. Но зачет возможен только после того, как агент вернул налогоплательщику излишне уплаченный налог, который переплатил за него в бюджет (п. 1 ст. 78 НК и п. 34 постановления Пленума ВАС от 30.07.2013 № 57).

Зачесть переплату по НДФЛ налогового агента можно, если налоговый агент по ошибке перечислил НДФЛ в бюджет больше, чем удержал у налогоплательщика, или перечислил досрочно. Однако переплату по всем налогам нельзя зачесть в счет предстоящих платежей по НДФЛ налогового агента.

Вернуть на счет или зачесть в счет предстоящих платежей можно сумму, которая останется после зачета всех недоимок по налогам, пеням и штрафам. Такие поправки в статьи 78–79 НК внес Закон от 29.09.2019 № 325-ФЗ.

Правила зачета страховых взносов не изменили: зачет можно проводить по видам бюджетов внебюджетных фондов. В счет уплаты налогов зачесть переплату по взносам нельзя (п. 1.1 ст. 78 НК).

Налог на профессиональный доход (далее – НПД) можно зачесть только по этому же налогу в счет предстоящих платежей или недоимки. Несмотря на то что это федеральный налог, общее правило о возможности зачета налогов любого вида в отношении НПД не действует. Также переплату по налогу на профессиональных доход можно вернуть на счет (п. 6 ст. 8 Закона от 27.11.2018 № 422-ФЗ).​​​